Según las estadísticas, la participación de Linux en el mercado de computadoras de escritorio ha aumentado al 11%, pero ese número incluye los Chromebooks, y las computadoras de escritorio tradicionales con Linux todavía sufren la misma fragmentación que acabó con Unix hace décadas. Steven J. Vaughan-Nichols, escribiendo en The Register, argumentó que la proliferación de escritorios Linux (ahora hay más de una docena de interfaces importantes, y DistroWatch enumera «más de cien») ha hecho que Es casi imposible para el usuario medio saber por dónde empezar..
Linus Torvalds estuvo hace mucho tiempo de acuerdo con esta hipótesis. «Tenemos demasiadas computadoras de escritorio», dijo Vaughn-Nichols, resumiendo la posición de Torvalds. El problema más profundo radica en la entrega de software: los administradores de paquetes tradicionales como DEB y RPM «simplemente no se adaptan al escritorio», lo que obliga a los creadores de distribuciones a reconstruir constantemente programas para sus entornos específicos. Se supone que las soluciones de contenedorización como Flatpaks, Snaps y AppImages resuelven este problema agrupando dependencias en paquetes comunes, pero la comunidad Linux sigue dividida sobre qué solución adoptar.
Por ejemplo, Linux Mint rechaza Snap porque «Canonical tiene demasiado control sobre el almacenamiento de Snap». El soporte de hardware complica aún más este desafío, escribe el veterano periodista. Si bien Dell vende máquinas Ubuntu y proveedores especializados como computadoras System76 y TUXEDO atienden a los entusiastas, «ninguno de ellos es fácil» para los compradores convencionales, y ninguno de los principales fabricantes de equipos originales respalda firmemente Linux. Torvalds señala los Chromebooks y Android como buenos ejemplos: Linux gana en los teléfonos inteligentes porque «hay una plataforma unificada, hay una forma unificada de instalar programas».
